El territorio del parque está sujeto a un plan de manejo en el que se identifican diferentes áreas de protección, donde las actividades o el acceso están condicionados, dependiendo de la importancia y sensibilidad de los valores naturales existentes:
Área de Medio Natural, donde la presencia humana se reduce y los ecosistemas permanecen poco alterados por el hombre. El régimen de protección en esta área puede ser:
- Área de protección total
- Área de protección parcial tipo I
- Área de protección parcial tipo II
Área de Medio Rural, donde se desarrollan la mayoría de las actividades humanas, con dos niveles de protección:
- Área de protección suplementaria tipo I
- Área de protección suplementaria tipo II
A flora e fauna do Parque Nacional Peneda-Gerês
O Gerês é um local espectacular pela diversidade de paisagens e vegetação exuberante da floresta caducifólia, verde claro ou escuro, tons de cobre ou castanho recortado em contraluz, dependendo da estação do ano.
A Flora do Peneda-Gerês
La cubierta vegetal de las montañas Gerês, Amarela, Peneda y Soajo y las mesetas Mourela y Castro Laboreiro está dominada por:
- Robles;
- formaciones arbustivas;
- lameiros;
- Vegetación ribereña.
A Fauna do Peneda-Gerês
El Corso es el símbolo del PNPG y está bien representado aquí, con varios grupos de población en situación favorable.
La trucha de río es abundante y la anguila está comercialmente amenazada. También están el topo de agua, la nutria, el mirlo de agua, el lagarto de agua, la rana ibérica y la salamandra portuguesa.
A diversidade de aves varia ao longo do ano e de nas várias áreas do Parque. A águia-real, a gralha-de-bico vermelho, o bufo-real, o falcão-abelheiro e anarceia, são algumas das aves presentes no Parque e que têm estatuto de conservação. A anarceja encontra no Parque Nacional da Peneda-Geres, o único local de reprodução conhecido em Portugal.